Mongólia folyói magasan a hegyekben erednek. Legtöbbjük pedig Szibéria és a Távol -Kelet legnagyobb folyóinak felső folyása.
Zheltura folyó
A folyómeder Burjánia (Oroszország) és Mongólia területén halad keresztül. Zheltura a Dzhida folyó jobb oldali mellékfolyója. A folyó forrása Mongólia földjein található. A folyócsatorna teljes hossza 202 kilométer, és szinte mindegyik áthalad az ország területén. Oroszország csak 18 kilométeres folyást jelent.
Az esőzések során a folyó fogadja a víz nagy részét. A magas víz nyáron fordul elő, amikor Mongólia sok csapadékot kap. A folyó torkolatánál Zheltura és Tengerek (Burjatija) falvak találhatók. A folyó vizeit aktívan használják ivóvízforrásként.
Menza folyó
A helyiek Minzhiin-Gol folyónak nevezik. Földrajzilag a csatorna áthalad Mongólián és Oroszországon, mivel ez a Chikoy folyó bal mellékfolyója. A Menza forrását a Baga-Khentai gerincen (Mongólia) veszi. A hegyekből leereszkedve áthalad a Bajkál-térség területén, és ismét visszatér Mongóliából. A folyócsatorna teljes hossza 337 kilométer.
A folyót november második felében jég borítja. A jégtörés április végétől kezdődik. A fagyasztás teljes időtartama 145-180 nap. Télen a folyó 130 centiméter felett fagy meg. A folyót lenok, taimen, sügér, burbot, szürkés és harcsa lakja.
Orkhon folyó
A folyómeder teljes egészében Mongólia területén húzódik, hossza 1124 kilométer. Orkhon Mongólia második leghosszabb folyója.
A folyó forrása a Khangai -hegységben található. A folyó felső folyása keskeny kanyonszerű völgy mentén húzódik. Az Orkhon felső folyása meglehetősen magas (20 méter) és széles (10 méter) vízesést képez. A folyó középső folyása mély kanyargó völgyön halad át, és csak a hegyek elhagyásakor a folyó 150 méterre nő. Orkhont novembertől áprilisig jég borítja.
A folyó völgyében sok érdekes látnivaló található: Khara -Balgas - egy ősi város, amely az ujgur állam fővárosa volt; Karakorum a Mongol Birodalom fővárosa. Ezenkívül számos hun temetkezési sírt találtak a folyó völgyében.
Egiin-Gol folyó
A folyó áthalad Mongólia területén. Teljes hossza 475 kilométer. A folyó forrása a Khubsugul -tó vize. Egiin-Gol lassan a távoli Selenga felé viszi vizeit. Októbertől április végéig a folyót jég borítja, és vonzó hely lesz a téli horgászat szerelmeseinek. Itt találhatók - szürkés, lenok, taimen. Középfolyásán a folyó sok ágra szakad.
