Ufa története az ötödik századra nyúlik vissza. Feltehetően középkori település helyezkedett el a modern Ufa területén. Az Arany Horda legnagyobb városai közül a XIV. Század kiemelkedő arab szerzője, Ibn Khaldun, Baskort (Bashgird) városának nevezték. Most, összehasonlítva az ősi térképeket és megnevezéseket, a történészek arra a következtetésre jutnak, hogy a fent említett régi város helyén találhatók Ufa állványai.
Hivatalos városi státusz
A XVI. Században, a mai Ufa területén, a Nogai Horda kormányzójának, Tura Khannak a téli központja volt. Miután Baškortosztán egy része belépett a moszkvai királyságba (1557), a helyi lakosok IV. Ivánhoz fordultak azzal a javaslattal, hogy várost építsenek földjeikre.
A XVI. Században (1574) a Sutoloka folyó közelében erődöt építettek, vagyis erődöt, és a helyet Ufa kerületnek kezdték nevezni, és Ufa lett a központja. Az ufai börtönt Nagy Iván vezetésével építették. Később a fővárosból küldve Mihail Nagoy volt a kerület első vajda, ő vezette az ufai jegyzőkunyhót (kétszáz íjász volt a parancsnoksága alatt).
A városfalak építése után az erőd Kreml néven vált ismertté. Kiegészítő védelemként kerítést építettek köré a szorosan egymás mellé hajtott tömör rönkökből, a szerkezet két ellentétes oldalán, az északi és déli részeken pedig tölgyfa tornyot emeltek.
A tizennyolcadik században a várost a parasztháború sújtotta, a felkelést elfojtották. Ezt követően Ufa egyesült a Kazan tartományt, kicsit később - az Orenburg tartományt. A 19. század elején a helyi hatóságok várostervezéssel foglalkoztak. V. Geste építész tervrajzot készített a város kibővített utcáiról. A Bolshaya Kazanskaya utcát a jövő Gosztiny Dvor és a Verkhne-Torgovaya térre hozták.
A huszadik század
1922 júliusában az Összoroszországi Központi Végrehajtó Bizottság döntésével megszüntették Ufa tartományt. A múlt század 20-30-as éveiben a város rohamos fejlődésnek indult. A bruttó ipari termelés 16 -szorosára nőtt. A Nagy Honvédő Háború idején több tucat ipari vállalkozást evakuáltak Ufába. Itt több kutatóintézetet is evakuáltak.
A háború utáni olajkitermelés növekedésével összefüggésben Ufában nagy olajfinomítókat építettek, aktívan fejlődött a gépgyártás és a vegyipar.